W 1906 roku, 10 lat po zorganizowaniu pierwszych igrzysk olimpijskich w Atenach, odbyła się olimpiada niezwykła, nie przewidziana regulaminem. Decyzja Grecji o organizacji imprezy spotkała się początkowo z ostrą krytyką niektórych komitetów olimpijskich. Jednak ich opinia stopniowo zmieniała się na lepsze ze względu na fakt, że wiele krajów nie mogło wysłać poważnych drużyn do St. Louis lub w ogóle nie wzięło udziału w Igrzyskach 1904 z powodu wysokich kosztów drogi do Stanów.
Igrzyska Olimpijskie, w cieniu międzynarodowych targów, przeżywały długotrwały kryzys. Na tle obecnej sytuacji Grecy, jako kustosze antycznej kultury Hellenów, mogli odbyć Międzyolimpiadę. Mimo, że Olimpiada Ateńska 1906 była pierwszą i jedyną tego typu imprezą, a jej wyniki nie zostały uznane za oficjalne, organizatorzy poradzili sobie z zadaniem: tchnąć życie w wyblakły projekt.
Forum Greckie, w przeciwieństwie do swoich dwóch oficjalnych poprzedników, nie było zbyt rozciągnięte w czasie i zdołało stać się wydarzeniem globalnym, gromadząc rekordową jak na tamte czasy publiczność – 884 sportowców reprezentujących 20 krajów.
Po raz pierwszy w historii Igrzysk wszyscy uczestnicy przeszli procedurę rejestracji w Narodowych Komitetach Olimpijskich. Po raz pierwszy widzowie obejrzeli także ceremonię otwarcia i zamknięcia Igrzysk, paradę olimpijczyków i wzniesienie się nad trybunami narodowych sztandarów ku czci zwycięzców.
Ciekawe są również fakty dotyczące uczestników Igrzysk Olimpijskich w 1906 roku. Ray Yuri - 8-krotny mistrz olimpijski w lekkoatletyce na Interolimpiadzie wygrał skok w dal z miejsca (3 m 30 cm) oraz skok wzwyż z miejsca (1 m 56 cm). Gdyby te wyniki wziąć pod uwagę, wyprzedziłby w złocie Paavo Nurmi i Carla Lewisa (po 9 złotych medali). Aby wziąć udział w igrzyskach olimpijskich w Sztokholmie, które odbyły się w 1912 r., Ray Yuri nie mógł już ze względu na swój wiek, miał 39 lat.
Paul Pilgrim, biegacz z USA, wygrał dwa dystanse 400 i 800 metrów. Ten wynik powtórzył dopiero 70 lat później lekkoatleta Alberto Juantorena na igrzyskach olimpijskich w Montrealu.
Kanadyjski biegacz Billy Shering przybył do Grecji na 2 miesiące przed igrzyskami, aby przystosować się do lokalnych warunków. Jego wysiłki nie poszły na marne, niespodziewanie wygrał maraton dla wszystkich. Książę koronny Georg z Grecji poprowadził finałową rundę stadionu z Scheringiem.
Na Igrzyskach Międzyolimpijskich w 1906 fińscy sportowcy rywalizowali po raz pierwszy i natychmiast zdobyli złoto. Werner Järvinen otrzymał medal za rzut dyskiem w stylu antycznym.
Najwięcej nagród na olimpiadzie zdobył Amerykanin irlandzkiego pochodzenia Martin Sheridan. Otrzymał złoto za pchnięcie kulą i rzut dyskiem w stylu klasycznym. Za skok w dal i wzwyż z miejsca zdobył srebro. Król Grecji podarował Sheridanowi włócznię zwycięzcy, która nadal znajduje się w ojczyźnie sportowca w Irlandii.